El objetivo de este proyecto, es que la información recopilada a través del Proyecto Punta San Juan sirva como insumo educativo para los colegios que participen, y que se desarrolle y ejecute un plan de acción participativo dirigido a reconectar los niños y sus familias con la naturaleza.
Se espera que los niños que participen de este proyecto, con el tiempo y con las actividades que se realicen, generen empatía por los seres vivos y puedan demostrar una comprensión de la relación intrínseca entre ellos mismos, su comunidad y el medio ambiente, así como una comprensión de la importancia de proteger la vida silvestre y la biodiversidad.